Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNBIP1Q9NSA3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CTNNBIP1Q9NSA3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms