Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KCNIP2Q9NS61 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KCNIP2Q9NS61 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms