Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PAPOLBQ9NRJ5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAPOLBQ9NRJ5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAPOLBQ9NRJ5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAPOLBQ9NRJ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAPOLBQ9NRJ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAPOLBQ9NRJ5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAPOLBQ9NRJ5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PAPOLBQ9NRJ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PAPOLBQ9NRJ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms