Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR21

PARP11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP11Q9NR21 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PARP11Q9NR21 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 766.7 ms