Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RPRD1BQ9NQG5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms