Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCDH12Q9NPG4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCDH12Q9NPG4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms