Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GPCPD1Q9NPB8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPCPD1Q9NPB8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms