Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP81

SARS2, Serine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARS2Q9NP81 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SARS2Q9NP81 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SARS2Q9NP81 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms