Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARFGAP3Q9NP61 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms