Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TUFT1Q9NNX1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUFT1Q9NNX1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms