Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.28■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EBF2Q9HAK2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms