Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF408Q9H9D4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF408Q9H9D4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms