Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6T3

RPAP3, RNA polymerase II-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP3Q9H6T3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPAP3Q9H6T3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPAP3Q9H6T3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms