Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLSTN2Q9H4D0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLSTN2Q9H4D0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms