Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LHX5Q9H2C1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHX5Q9H2C1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms