Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCOLN1Q9GZU1 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCOLN1Q9GZU1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCOLN1Q9GZU1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MCOLN1Q9GZU1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCOLN1Q9GZU1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms