Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCSER1Q9C0I3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCSER1Q9C0I3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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