Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I1

MTMR12, Myotubularin-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR12Q9C0I1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTMR12Q9C0I1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR12Q9C0I1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR12Q9C0I1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTMR12Q9C0I1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms