Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KRT23Q9C075 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KRT23Q9C075 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms