Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM31Q9BZY9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms