Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ERVK-6Q9BXR3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ERVK-6Q9BXR3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms