Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RAB11FIP5Q9BXF6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RAB11FIP5Q9BXF6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms