Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SSBP4Q9BWG4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms