Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC106Q9BWC9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC106Q9BWC9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms