Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HIGD2AQ9BW72 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms