Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
CHCHD7Q9BUK0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CHCHD7Q9BUK0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CHCHD7Q9BUK0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CHCHD7Q9BUK0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CHCHD7Q9BUK0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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CHCHD7Q9BUK0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CHCHD7Q9BUK0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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