Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUH8

BEGAIN, Brain-enriched guanylate kinase-associated protein, humanhuman

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEGAINQ9BUH8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BEGAINQ9BUH8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BEGAINQ9BUH8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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