Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RSG1Q9BU20 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms