Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PI4K2AQ9BTU6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms