Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
MCMBPQ9BTE3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
MCMBPQ9BTE3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms