Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM175Q9BSA9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM175Q9BSA9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms