Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EBF4Q9BQW3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EBF4Q9BQW3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms