Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
FYCO1Q9BQS8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FYCO1Q9BQS8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms