Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GDF15Q99988 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GDF15Q99988 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms