Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED1Q99966 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms