Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RBBP8Q99708 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RBBP8Q99708 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms