Protein–RNA interactions for Protein: Q99626

CDX2, Homeobox protein CDX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDX2Q99626 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDX2Q99626 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms