Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RIT2Q99578 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RIT2Q99578 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms