Protein–RNA interactions for Protein: Q99542

MMP19, Matrix metalloproteinase-19, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP19Q99542 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MMP19Q99542 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP19Q99542 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms