Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGMNQ99538 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LGMNQ99538 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LGMNQ99538 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LGMNQ99538 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LGMNQ99538 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LGMNQ99538 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LGMNQ99538 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LGMNQ99538 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms