Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRNP1Q96S65 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRNP1Q96S65 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSRNP1Q96S65 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CSRNP1Q96S65 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms