Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TGS1Q96RS0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TGS1Q96RS0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms