Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRAPPC9Q96Q05 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms