Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
AGAP3Q96P47 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AGAP3Q96P47 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms