Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SCLT1Q96NL6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SCLT1Q96NL6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms