Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RUNDC3BQ96NL0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms