Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SAMD8Q96LT4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SAMD8Q96LT4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms