Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SENP8Q96LD8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SENP8Q96LD8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms