Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CAPZA3Q96KX2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPZA3Q96KX2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms