Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHAMP1Q96JM3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHAMP1Q96JM3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms